Спустя год после разрушительной битвы Годзиллы с Мехагодзиллой, которая оставила большие части Токио в руинах, город все еще не до конца восстановился. Жители возвращаются к обычной жизни, но военные не прекращают работы по доработке Мехагодзиллы — уникального боевого робота, созданного для борьбы с древним чудовищем.
