Юный Давид живет в небольшой израильской деревне вместе с отцом, заботится об отцовском стаде овец и с детства отличается смелостью: он без страха защищает животных от хищников и проводит свободное время за игрой на арфе, сочиняя собственные мелодии. Однажды к нему приходит пророк Самуил и предрекает, что в будущем юноша станет правителем своего народа, но чтобы это сбылось, ему придется...
Гильермо дель Торо переосмыслил классическую историю Карло Коллоди, перенеся действие в довоенную Италию 1930-х годов и добавив в сюжет глубокие личные мотивы. Деревянная кукла Пиноккио создается старым резчиком Джепетто, который переживает смерть своего маленького сына и не может смириться с утратой — мальчик получает жизнь не как подарок, а как попытка заполнить пустоту в сердце отца.