«Мастера меча онлайн: Альтернативная призрачная пуля» — это отдельная история во вселенной популярной франшизы, действие которой разворачивается не в замкнутых подземельях Айнкарда, а в мире виртуальной игры Gun Gale Online, где основные сражения проходят на огнестрельном оружии, а не на мечах. Главная героиня сериала, Карэн, в реальном мире чувствует себя совершенно не на своем месте.
Обычный школьник Субару Нацуки возвращается из магазина с покупками, как вдруг оказывается в незнакомом месте посреди лесной дороги в мире, который сильно отличается от привычного ему Токио. Никого, кто мог бы объяснить, что происходит, рядом нет, а вскоре на парня нападают бандиты — только чудо в лице сереброволосой девушки Эмилии и её сопровождающего, пушистого кота Пак, спасают его от...
Действие разворачивается в мире, кардинально изменившемся после глобальной катастрофы под названием Инверсия. После этого события на планете появились люди с феноменальными физическими возможностями — Генестелла, для которых были созданы специальные учебные заведения, готовящие их к ответственной работе и защите граждан.
Действие аниме-сериала разворачивается в современной Японии, в небольшом храме плодородия, где семья главной героини Макото Саэки несет службу уже 14 поколений подряд. После смерти матери шестнадцатилетняя девочка берет на себя обязанности мико, и выясняется, что с детства она обладает даром общаться с духами, живущими рядом с храмом.